Mittlerweile ist die Anzahl der Kommentare auch auf der Startseite ersichtlich. War mit Anleitung erneut recht einfach. Kurz zusammengefasst und erweitert um das entsprechende Ghost-Spezifikum:

Irgendwo in der Artikel-Vorschau

<a href="/{{{url}}}#isso-thread">Comments</a>

einfügen. Ghost-spezifisch ist hier natürlich der {{{url}}}-Teil.
Dann noch das richtige Script (count.min.js) einbinden.

<script data-isso="//comments.example.tld/"
    src="//comments.example.tld/js/count.min.js"></script>
<section id="isso-thread"></section>

Fertig.